溶洞都分布在石灰巖組成的山地中，石灰巖層是溶洞形成的重慶溶洞設計先決條件，地下水在溶洞的形成過程中起了決定性的作用，其形成其實是石灰巖地區地下水長期溶蝕的結果。石灰巖的主要成分是碳酸鈣，當它遇到溶有二氧化碳的水時，會反應生成溶解性較大的碳酸氫鈣；溶有碳酸氫鈣的水遇熱或當壓強突然變小時，溶解在水里的碳酸氫鈣就會分解，重新生成碳酸鈣沉積下來，同時放出二氧化碳。洞頂的水在慢慢向下滲漏時，水中的碳酸氫鈣發生上述反應，有的沉積在洞頂，有的沉積在洞底，日久天長洞頂的形成鐘乳石，洞底的形成石筍。

    石筍和鐘乳石是親密伙伴。當洞頂上的水滴落下來時，石灰質也在地面上沉積起來。就這樣，石筍對著鐘乳石向上長。鐘乳石是“先生”，石筍是“后生”，但石筍底盤大，本身比較穩定，不容易折斷，所以它的“生長”速度常比鐘乳石還快。石筍的最大高度能達30米，像是一座平地里長出來的“石塔”。 往下長的鐘乳石，有時候也會和往上長的石筍接在一起，連接成一個石柱，那些頂天立地的“靈芝柱”，就是石筍和石鐘乳對接起來之后形成的，石柱兩頭粗，中間細，不明底細的人還認為是誰鑿出來的呢。

    在許多石灰巖洞里，鐘乳石和石筍多數不是連在一起的；那是因為重慶溶洞設計不是鐘乳石折斷了，就是過多的石灰質堵塞了水滴的通路，水滴被迫改變路徑轉移到另一處，又長出一根新的鐘乳石。這樣，鐘乳石和石筍就不會“碰頭”了。日積月累，溶洞中就會出現一道溝或是一個洞，或是一根鐘乳石，或是一根石筍，或是一根石柱，把它們組合在一起就成了“樹林”、“珠簾”等奇麗景象了。